O sistema de batalhas de Advanced Wars: Dual Strike funciona através de turnos. A cada jogada, é possível mover unidades, atacar ou realizar ações específicas. Os mapas nos quais as batalhas ocorrem são dispostos através de grades que medem e restringem o avanço a cada turno.

O jogo apresenta uma série de modos bastante variados que tornam a experiência ainda mais interessante. O modo War Room, por exemplo, coloca você em um mapa contra um ou mais comandantes com um número determinado de missões para comprir. Já no modo Survival você deve sobreviver aos ataques de seus oponentes durante um certo número de turnos, um certo período de tempo ou até que você recolha uma determinada quantia em dinheiro.